Поиск
Логин:
Пароль:
Восстановить пароль
Регистрация
Владислав Владимирович Бирюков


В группах
Студенты
Администраторы
Выпуск 2018г. ББ16-06М
Аспиранты

Образование:

  • С 2018 – аспирант Института фундаментальной биологии и биотехнологии Сибирского федерального университета (Программа «Физиология и биохимия растений»)

  • 2016-2018 Институт фундаментальной биологии и биотехнологии Сибирского федерального университета (Магистерская программа «Геномика и биоинформатика»)
    Диплом магистра с отличием

Тема магистерской диссертации: "Поиск таргетных последовательностей для различных микроРНК в сборке транскриптома лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.)"

  • 2012-2016 Институт фундаментальной биологии и биотехнологии Сибирского федерального университета, кафедра биофизики
    Диплом бакалавра с отличием
Тема выпускной бакалаврской работы: "De novo сборка транскриптома лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) и анализ его статистических и комбинаторных свойств"

Научный руководитель: Садовский Михаил Георгиевич

Онлайн-курсы:

  1. Introduction to Bioconductor: Annotation and Analysis of Genomes and Genomic Assays Harvard University via edX;
  2. Statistics and R Harvard University via edX
  3. Анализ данных в R Институт биоинформатики (Stepik.org) Сертификат
  4. Learn Spanish: Basic Spanish for English Speakers Universitat Politècnica de València via edX Сертификат
  5. Programming for Everybody (Python) University of Michigan via Coursera
  6. Bioinformatics: Life Sciences on Your Computer Johns Hopkins University via Coursera
  7. The Data Scientist’s Toolbox Johns Hopkins University via Coursera
  8. Введение в биоинформатику (Introduction to Bioinformatics) Санкт-Петербургский государственный университет via Coursera

Опыт работы:

  • С июня 2014 г. по настоящее время – исполнитель НИР по проекту «Геномные исследования основных бореальных лесообразующих хвойных видов и их наиболее опасных патогенов в Российской Федерации»
  • Участник проекта РФФИ №18-38-00531 Создание биолюминесцентного аптасенсора на основе ДНК-аптамеров и фотопротеина обелина для детекции кардиомаркера тропонина I

Конференции, школы:

  1. 11th International Multiconference “Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology” — BGRS\SB-2018, г. Новосибирск;
  2. The First International Conference on Symmetry, Barcelona, Spain;
  3. Выездной семинар по системной биологии, г. Санкт-Петербург
  4. 53-я Международная научная студенческая конференция, г. Новосибирск;
  5. Международная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых «Проспект Свободный-2015»;
  6. Седьмая Международная Школа молодых ученых «Системная биология и биоинформатика», г. Новосибирск;  Сертификат_SBB2015 (1.5Mб, JPG)
  7. Третья летняя школа по биоинформатике, г. Москва.  Летняя школа (1Mб, JPG)

Статьи:

  1. Michael Sadovsky, Yulia Putintseva, Vladislav Birukov, Serafima Novikova, and Konstantin Krutovsky De Novo Assembly and Cluster Analysis of Siberian Larch Transcriptome and Genome // Lecture Notes in Computer Science. – 9656. – Pp. 455-464. DOI: 10.1007/978-3-319-31744-1_41
  2. М.Г. Садовский, В.В. Бирюков, Ю.А. Путинцева,Н.В. Орешкова, Е.А. Ваганов, К.В. Крутовский Симметрия транскриптома сибирской лиственницы // Journal of Siberian Federal University. Biology. – 2015.–8(3). – С. 278-286. DOI: 10.17516/1997-1389-2015-8-3-278-286
  3. Michael G. Sadovsky, Vladislav V. Birukov, Yuliya A. Putintseva, Konstantin V. Krutovsky Intriguing symmetry in statistical structures of Siberian larch transcriptome [Электронный ресурс] // Препринт arXiv (Расширенная версия документа, представленного на IWBBIO-2016, Гранада, Испания). Режим доступа: https://arxiv.org/abs/1604.00001

Тезисы:

  1. V. Biriukov, N. Oreshkova, Yu. Putintseva, K. Krutovsky (2018) Identification of targets genes for miRNAs of the pathogenic fungus Fusarium oxysporum in a de novo transcriptome assembly of the Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.). Abstracts of The Eleventh International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB-2018)
  2. Yu. Putintseva, V. Sharov, D. Kuzmin, N. Oreshkova, S. Feranchuk, V. Biryukov, S. Novikova, K. Miroshnikova, S. Makolov, M. Sadovsky, K. Krutovsky (2018) Genomes of three conifer species: Larix sibirica, Pinus sibirica and Pinus sylvestris. Abstracts of The Eleventh International Conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology (BGRS\SB-2018)
  3. Vladislav V. Biriukov, Michael G. Sadovsky, Yuliya A. Putintseva, Natalia V. Oreshkova, Konstantin V. Krutovsky (2018). Symmetry in the Transcriptome and Genome Sequences of Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.). Proceedings 2018, 2(1), 56 doi:10.3390/proceedings2010056
  4. Krutovsky K.V., Oreshkova N.V., Putintseva Yu.A., Kuzmin D.A., Sharov V.V., Biryukov V.V., Makolov S.V., Deych K.O., Bondar E.I., Ushakova O.A., Ibe A.A., Shilkina E.A. DE NOVO SEQUENCING OF CONIFER MEGAGENOMES // Материалы 3-й международной конференции “Генетика, геномика, биоинформатика и биотехнология растений”. – 2015. – С. 28;
  5. Oreshkova N.V., Putintseva Yu.A., Kuzmin D.A., Sharov V.V., Biryukov V.V., Makolov S.V., Deych K.O., Ibe A.A., Shilkina E.A., Krutovsky K.V. THE WHOLE DE NOVO GENOME SEQUENCING AND ASSEMBLY OF SIBERIAN LARCH (LARIX SIBIRICA LEDEB.) AND SIBERIAN PINE (PINUS SIBIRICA DU TOUR.) // Материалы 3-й международной конференции “Генетика, геномика, биоинформатика и биотехнология растений”. – 2015. – С. 37;
  6. Krutovsky K.V., Oreshkova N.V., Putintseva Yu.A., Kuzmin D.A., Pavlov I.N., Sharov V.V., Biryukov V.V., Makolov S.V., Deych K.O., Bondar E.I., Ushakova O.A., Ibe A.A., Shilkina E.A., Sadovsky M.G., Vaganov E.A. Pinus sibirica and Larix sibirica whole genome de novo sequencing // The ProCoGen Final Open International Conference and Workshops on Promoting Conifer Genomic Resources. – 2015. – O-07;
  7. Орешкова, Н.В., Ю.А. Путинцева, Д.А. Кузмин, В.В. Шаров, В.В. Бирюков, К.О. Дейч, A.A. Ибе, E.A. Шилкина, К.В. Крутовский Секвенирование и сборка геномов лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) и сосны сибирской кедровой (Pinus sibirica Du Tour) и предварительные данные анализа транскриптома// Материалы 4-го международного совещания “Сохранение лесных генетических ресурсов Сибири”. – 2015 г. – С. 127-128;
  8. В.В. Бирюков De novo сборка транскриптома лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) // Материалы 53-й Международной научной студенческой конференции. – 2015. – С. 177;
  9. V.V. Biryukov De novo transcriptome assembly of the Siberian larch // Abstracts of the 7th International Young Scientists School “Systems Biology and Bioinformatics”. – 2015. – С. 11;
  10. Бирюков В.В. De novo сборка транскриптома лиственницы сибирской // Сборник материалов Международной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых «Проспект Свободный-2015». – 2015. – С. 4-5;
  11. В.В. Бирюков De novo сборка транскриптома лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) // Сборник тезисов третьей летней школы по биоинформатике. – 2015. – С. 8;

Научные интересы:
Биоинформатика, молекулярная биология, некодирующие РНК, эпигенетика

Файлы пользователя
 4256  Сертификаты, грамоты
© 2008–2019 Институт фундаментальной биологии и биотехнологии, СФУ